%%capture
%%R
<- redcap_report(
cases_oct_2023 = url,
redcap_uri = token,
token = 2178
report_id )$data
9 Reports
To export reports via API you will need the ‘Report ID’ of your desired report. You can find the ‘Report ID’ of the report you want to export by going into your REDCap project and selecting ‘Data Export, Reports, and Stats’, then ‘My Reports & Exports’.
9.1 Exporting Raw Reports
In this example, we will export the ‘Cases in October 2023’ report as seen in the image above.
redcap_report()
export_report()
='2178', format_type='df', raw_or_label='raw').reset_index().head(7) project.export_report(report_id
record_id | redcap_event_name | redcap_repeat_instrument | redcap_repeat_instance | first_name | last_name | phone_num | zip_code | dob | age | ... | symptoms_yesno | symptom_onset | symptoms_exp | symptom_notes | test_yesno | test_positive_yesno | test_positive_date | test_upload | prior_covid_yesno | prior_covid_date | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
0 | 1 | notifications_arm_1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | ... | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
1 | 1 | personal_info_arm_1 | NaN | NaN | John | Doe | (999) 999-9999 | 98105.0 | 2006-04-11 | 18.0 | ... | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
2 | 1 | case_intake_arm_1 | NaN | 1.0 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | ... | 1.0 | 2023-10-09 | 1,2,7 | NaN | 1.0 | 1.0 | 2023-10-10 | test_api_export_image.png | 0.0 | NaN |
3 | 2 | notifications_arm_1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | ... | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
4 | 2 | personal_info_arm_1 | NaN | NaN | Jane | Doe | (999) 999-9999 | 98105.0 | 1994-06-29 | 29.0 | ... | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
5 | 2 | case_intake_arm_1 | NaN | 2.0 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | ... | 1.0 | 2021-06-05 | 1,2,3,4,5,7,8,9 | NaN | 1.0 | 1.0 | 2021-06-07 | test_api_export_pdf.pdf | 0.0 | NaN |
6 | 2 | case_intake_arm_1 | NaN | 1.0 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | ... | 1.0 | 2023-10-11 | 1,2,8 | NaN | 1.0 | 1.0 | 2023-10-12 | test_api_export_pdf.pdf | 1.0 | 2021-06-06 |
7 rows × 23 columns
9.2 Exporting Labeled Reports
Reports can also be exported as labeled data.
%%capture
%%R
<- redcap_report(
cases_oct_2023_labeled = url,
redcap_uri = token,
token = 2178,
report_id = 'label'
raw_or_label )$data
='2178', format_type='df', raw_or_label='label').reset_index().head(7) project.export_report(report_id
record_id | redcap_event_name | redcap_repeat_instrument | redcap_repeat_instance | first_name | last_name | phone_num | zip_code | dob | age | ... | symptoms_yesno | symptom_onset | symptoms_exp | symptom_notes | test_yesno | test_positive_yesno | test_positive_date | test_upload | prior_covid_yesno | prior_covid_date | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
0 | 1 | Notifications | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | ... | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
1 | 1 | Personal Info | NaN | NaN | John | Doe | (999) 999-9999 | 98105.0 | 2006-04-11 | 18.0 | ... | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
2 | 1 | Case Intake | NaN | 1.0 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | ... | Yes | 2023-10-09 | Sore Throat,Cough,Congestion | NaN | Yes | Yes | 2023-10-10 | test_api_export_image.png | No | NaN |
3 | 2 | Notifications | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | ... | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
4 | 2 | Personal Info | NaN | NaN | Jane | Doe | (999) 999-9999 | 98105.0 | 1994-06-29 | 29.0 | ... | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
5 | 2 | Case Intake | NaN | 2.0 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | ... | Yes | 2021-06-05 | Sore Throat,Cough,Shortness of Breath,Chest Pa... | NaN | Yes | Yes | 2021-06-07 | test_api_export_pdf.pdf | No | NaN |
6 | 2 | Case Intake | NaN | 1.0 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | ... | Yes | 2023-10-11 | Sore Throat,Cough,Fever | NaN | Yes | Yes | 2023-10-12 | test_api_export_pdf.pdf | Yes | 2021-06-06 |
7 rows × 23 columns
Note: Exporting labeled headers only works when format_type='csv'
. See Section 20.4 for more information.